原位雜交結(jié)合免疫組織化學(xué)技術(shù)主要用于在同一細(xì)胞 內(nèi)同時(shí)或先后檢測特定基因在核酸和蛋白質(zhì)或多肽水平的表達(dá)，這樣。不僅能了解基因表達(dá)，而且還能研究某種基因表達(dá)的翻譯和轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)。如果免疫組織化學(xué)檢測的抗原成分是與原位雜交的靶核酸不同基因編碼的蛋白質(zhì)或多肽等，那么同時(shí)使用原位雜交和免疫組織化學(xué)技術(shù)可研究一種基因的轉(zhuǎn)錄與另一種基因編碼的蛋白質(zhì)合成之間的相互關(guān)系。在病毒學(xué)研究中，將原位雜交與免疫組織化學(xué)相結(jié)合．可在細(xì)胞水平上同時(shí)研究病毒基因及其表達(dá)產(chǎn)物。即病毒抗原的分布。如果將檢測病毒基因的原位雜交與檢測細(xì)胞類型特異性抗原的免疫組織化學(xué)相結(jié)合，則可鑒別受染細(xì)胞的類型，尤其對(duì)在含多種細(xì)胞類型的組織(如神經(jīng)組織)中確定受染細(xì)胞的類型更有幫助。總之，原位雜交和免疫組織化學(xué)結(jié)合的雙標(biāo)記技術(shù)在深入研究基因表達(dá)的調(diào)控以及病毒性疾病的發(fā)病機(jī)制等方面具有廣闊的應(yīng)用前景。

    原位雜交結(jié)合免疫組織化學(xué)技術(shù)可以分別在相鄰的連續(xù)切片上進(jìn)行。只要在相鄰切片上能得到同一細(xì)胞的連續(xù)切面。對(duì)照觀察相鄰切片上同一細(xì)胞切面原位雜交和免疫組織化學(xué)結(jié)果，就可以判斷在同一細(xì)胞內(nèi)是否存在特定的靶核酸DNA或RNA和由該基因或另一種基因編碼的蛋白質(zhì)或多肽。

    原位雜交結(jié)合免疫組織化學(xué)技術(shù)更多的是在同一細(xì)胞標(biāo)本或組織切片上進(jìn)行，這樣可避免因相鄰切片法觀察時(shí)不易找到同一細(xì)胞的切面而產(chǎn)生的空間誤差和樣本誤差。但采用同一切片的雙標(biāo)記技術(shù)時(shí)。*次標(biāo)記染色過程總要或多或少地影響第二次標(biāo)記染色的結(jié)果，使第二次染色結(jié)果不很理想。

    在同一細(xì)胞和切片標(biāo)本上進(jìn)行原位雜交和免疫組織化學(xué)雙標(biāo)記時(shí)．可以先用原位雜交檢測核酸，也可以先用免疫組織化學(xué)檢測蛋白質(zhì)．不同的檢測程序各有其優(yōu)缺點(diǎn)。